К числу острейших проблем в сфере налогообложения в 1990-е гг. можно отнести противоречия между центром, регионами и органами местного самоуправления высокий общий уровень налогового бремени, его неравномерное распределение по отраслям экономики, территориям и отдельным категориям налогоплательщиков неоправданно большое число платежей по всем уровням налоговой системы сложность и методологическая неотработанность законодательных норм и правил исчисления платежей множественность и недостаточная обоснованность налоговых льгот и многие другие.