Великая Отечественная война нарушила поступательный ход начавшегося комплексного развития Башкортостана. Строительство многих важных объектов третьего пятилетнего плана, направленное на совершенствование отраслевой и территориальной структуры комплекса, было приостановлено или вовсе не начато.