Функционирование ФОМС преследует цель аккумулирования финансовых средств и обеспечения стабильности государственной системы обязательного медицинского страхования. Основными задачами Федерального ФОМС являются финансовое обеспечение установленных законодательством прав граждан на медицинскую помощь за счет средств обязательного медицинского страхования обеспечение финансовой устойчивости системы обязательного медицинского страхования и создания условий для выравнивания объема и качества медицинской помощи, предоставляемой гражданам на всей территории Российской Федерации в рамках базовой кампании обязательного медицинского страхования аккумулирование финансовых средств фонда для обеспечения финансовой стабильности системы выравнивание условий деятельности территориальных фондов обязательного медицинского страхования разработка размеров взносов на обязательное медицинское страхование аккумулирование финансовых средств Федерального фонда выделение средств территориальным фондам обязательного медицинского страхования, в том числе на безвозвратной основе контроль за своевременным и полным перечислением страховых взносов в фонды медицинского страхования, контроль за рациональным использованием средств в системе обязательного медицинского страхования подготовка и предоставление предложений по совершенствованию законодательных актов по вопросам обязательного медицинского страхования изучение практики применения законодательства по вопросам обязательного медицинского страхования.