Положение о депозитарной деятельности устанавливает требование к организациям, осуществляющим такую деятельность, о формировании отдельных подразделений, для которых депозитарная деятельность является исключительной (однако в настоящее время формально не определено само понятие отдельного подразделения). В зависимости от структуры в банках могут быть созданы как управление или отдел, так и сектор в рамках отдела.