Просматривая записи, сделанные во время плаванья, Дарвин пришел в недоумение. Почему птицы и черепахи, обнаруженные на некоторых островах архипелага, напоминали виды, живущие в Южной Америке, а птицы и черепахи, обитавшие на других островах, не были похожи на южноамериканских сородичей Это наблюдение еще сильнее взбудоражило Дарвина, когда он узнал, что вьюрки, которых он привез с Галапагосских островов, принадлежат к разным видам, а не являются простыми разновидностями одного вида, как он считал ранее. Дарвин также обнаружил, что собранные им птицы-пересмешники принадлежат к трем различным видам, а черепахи представляют два вида. Он назвал эти тревожащие его вопросы проблема видов и изложил свои наблюдения в тетради, которую позднее озаглавил Тетрадь о превращении видов .