Хотя функциональное управление в настоящее время известно достаточно широко, уже давно было признано, что оно сопряжено со многими практическими трудностями. Разные функциональные структуры часто имеют очень узкий взгляд на решаемые проблемы и не заинтересованы в том, что прямо их не касается. Приходится наблюдать, например, как бухгалтерия заинтересована в получении производственной и финансовой информации, и ее совершенно не волнуют факторы, которые делают ситуацию такой, какая она есть. В итоге создается впечатление, что люди, занятые общим делом, ведут себя так, как будто их ничего не связывает.