Производственная структура предприятия определяется при проектировании. Однако это не исключает возможности совершенствования производственной структуры действующих предприятий со сложившейся схемой производства. Совершенствование производственной структуры нефтеперерабатывающих и нефтехимических предприятий предполагает правильное определение размера предприятия, его специализации, принципа построения и состава цехов, повышение степени автоматизации, более широкое развитие комбинирования и кооперирования, улучшение структуры производственных процессов.