Двусторонним или попарным зачетом называется зачет, происходящий между одними и теми же сторонами. Этот способ поддерживает целостность торговли между сторонами и уменьшает объем операций по сравнению с единичным подходом. Так можно достичь существенного повышения эффективности, но только при большом числе сделок по сравнительно узкому кругу ценных бумаг.